雌性生殖系统由卵巢、输卵管、受精囊、附性腺和外生殖器组成。蜂王腹内有两个巨大的梨形卵巢，每个卵巢由100〜150多条卵巢管紧密地聚集在一起形成。每条卵巢管由y连串的卵室和滋养细胞室相间组成。卵就在卵室内发育，成熟的卵在卵基部汇入侧输卵管，两侧输卵管再汇合为中输卵管。中输卵管的后端膨大为阴道。阴道口位于蜇针基部下方，两侧还有一对侧交配囊的开口。阴道背面有一圆球状的受精囊，是蜂王接收和贮精子的特殊器官，受精囊与阴道之间有相通的受精囊管，此外，受精囊上还有一对受精囊腺，汇合后与受精囊管的顶端相连。工蜂的生殖器已显著退化，卵巢仅具有3~8条卵巢管，受精囊仅存痕迹，其他附属器官也已退化，失去正常的交配和生殖机能。

蜂王的卵巢中，每条卵巢管内部都有原始雌性生殖细胞，卵原细胞。这些细胞在管内向下移动过程中，增殖和分化成个体较大的卵母细胞，然后成为卵子和另一种较小的滋卵细胞。较老的卵子，每个都伴随着一团滋卵细胞，体积逐渐增大。剖开卵巢管，就可看到一连串交替间隔着的卵室和滋卵细胞吸收，并由卵室壁（卵泡囊).分泌一个卵壳，将卵包裹。