蜜蜂的消化系统是从口到肛门的一条长的消化管，可分前肠、中肠和后肠三部分，中后肠分界处有用于排泄的马氏管，直肠壁上有直肠腺。

前肠由咽、食道、蜜囊和前胃组成。咽紧接口器下方，膨大为食窦，食窦壁上有发达的肌纤维交叉环绕，肌肉的伸缩适于吮吸和反吐液体食物，起到抽吸泵的作用。

咽后连接细长的食道，食道后段迂回通过颈和胸部，并与腹部前端的蜜囊连接，蜜囊是携带花蜜用的。蜜囊下接短而窄的前胃，前胃是食物进入中胸的调节器，前胃的前端突起伸入蜜囊中，其端部形成裂口的肉唇，有4个三角形唇瓣控制开合。

前胃的后端形成一个长漏斗形的活动瓣膜内，当唇瓣紧闭时，迫使花蜜进入中肠，而贮藏在蜜囊内，并能通过蜜囊的收缩把食物吐回口腔，当唇瓣开放时，食物便可从蜜囊进入中肠，蜜囊的收缩性很大。