中华蜂对保持我国植物生态系统具有不可替代的作用，研究表明一旦中蜂灭绝，我国将有30%的植物灭绝，目前因中蜂的减产，导致一些国家级二级保护植物濒临灭绝。 2006
中华蜂对保持我国植物生态系统具有不可替代的作用，研究表明一旦中蜂灭绝，我国将有30%的植物灭绝，目前因中蜂的减产，导致一些国家级二级保护植物濒临灭绝。
2006年，中华蜜蜂已被列入国家畜禽遗传资源保护名录，也是十大畜禽遗传资源保护品种之一，是我国宝贵的蜂种资源。
中华蜜蜂有7000万年进化史。在中国，中华蜜蜂抗寒抗敌害能力远远超过西方蜂种，一些冬季开花的植物如无中华蜜蜂授粉，必然影响生存。中国许多植物繁衍下来，中华蜜蜂功不可没。中华蜜蜂为苹果授粉率比西蜂高30%，且耐低温、出勤早、善于搜集零星蜜源，对保护生态环境意义重大。而洋蜂的嗅觉与中国很多树种不相配，因此不能给这些植物授粉。由于毁林造田、滥施农药、环境污染等因素，造成中华蜜蜂生存危机。而引入的意大利等国的洋蜂，是对中蜂最大的威胁。这些洋蜂对中华蜜蜂有很强的攻击力，且翅膀振动频率与中华雄蜂相似，导致中华蜜蜂误认，从而可以顺利进入蜂巢，还得到相当于同伴的待遇和饲喂。不同种群不能共存，洋蜂杀死中蜂蜂王不可避免。自1896西方蜜蜂（Apis mellifera L.）的优良品种如意大利蜂（Apis mellifera ligustica Spinola）和喀尼阿兰蜂（Apis mellifera Carnica Pollmann）的引进和大量的繁育以来，中华蜜蜂受到了严重威胁，分布区域缩小了75%以上，种群数量减少80%以上。黄河以北地区，只在一些山区保留少量中华蜜蜂，如长白山区、太行山区、燕山山区、吕梁山区、祁连山区等，并处于濒危状态，蜂群数量减少95%以上；新疆、大兴安岭和长江流域的平原地区中华蜜蜂已灭绝，半山区处于濒危状态，大山区如神农架山区、秦岭、大别山区、武夷山区、浙江南部、湖南南部、江西东部、南部山区、南岭、十万大山等地区处于易危和稀有状态，蜂群减少60%以上；只在云南怒江流域、四川西部、西藏还保存自然生存状态。
中华蜜蜂起着重要的平衡生态作用，特别有利于高寒山区的植物，华北地区的很多树种都是早春或是晚秋开花的，还有的是零零星星开花的，如果没有中华蜜蜂，植物的受粉就会受到影响，这也是其它蜂种所不具备的特性。中华蜜蜂一旦完全灭绝，会影响整个与之有关的植物共生生态系统的变化。一只优良的中华蜜蜂蜂王在产卵期每昼夜可产卵1500粒左右，它的平均寿命为3~5年，最长的可达8~9年。然而20世纪末，中华蜜蜂在北方地区，黄河以北逐步减少了，长白山也只剩下几百群了。中华蜜蜂的减少，主要是蜂王由于不明原因死亡而造成的。
养蜂业近年来，中华蜂的囊状幼虫病发病频率较高，危害性更大，2011年国内曾经研发出中药用于中蜂囊状幼虫病的治疗，但中药治疗主要是通过免疫调节作用，间接抗病毒，并不能直接杀死病毒，相对起效慢，有复发，同时由于中药有味也往往使得蜜蜂不能很好的采食，甚至于发生逃逸，尤其是对重病蜂群治愈效果较
