小蜂螨常与大蜂螨一起共同危害意蜂蜂群。大蜂螨的种群密度高会抑制小蜂螨的危害，降低其种群密度。在东南亚地区，由于大蜂螨发生时间早，适应能力强，造成小蜂螨危害相对减轻。
小蜂螨与溫度的关系
温度对小蜂螨的影响很大。据中国农业科学院蜜蜂研究所北京地区室内饲养观察，成螨在9.8℃、12.7℃、31.9℃、34.5℃和36.3℃条件下，存活天数分别为1.9天、3.7天、8.4天、9.6天和6.8天。小蜂螨生活的最适温度与蜜蜂子脾大体一致，离开子脾后存活不超过2天。
小蜂螨与蜜蜂群势的关系
据北京地区观察，在每年6月份以前，由于蜂群群势不强,很少査到小蜂螨。到了7月中旬以后，小蜂螨寄生率呈直线上升，到9月中旬达到最髙峰。到11月上旬以后，外界气温下降至10℃以下，蜂群又基本査不到小蜂螨。另外，小蜂螨多发生在弱群、病群以及无王群。