为了加快蜂胶有效成分溶入溶剂中，必须对其进行粉碎，以增加蜂胶和溶剂的接触面积，溶出速度也随之加快。由于蜂胶遇热变软，很容易粘附在容器上，因此，经冷冻后的蜂胶应尽快进行粉碎。

球磨机是一种适合用于粉碎结晶物料、易熔化的树脂、树胶以及其他非组织性脆性物料的粉碎设备。在操作时，将大块蜂胶用手工进行粗破碎，然后装入球磨机的罐内并盖严，由电动机带动球罐转动，转速控制在使其中的圆球能在一定的角度落下的速度，蜂胶则因圆球起落产生的撞击作用与圆球和罐壁及球与球之间的研磨作用而被粉碎。

蜂胶一般被粉碎到20目即可，不可粉碎得过小，否则蜂胶提取液在过滤时很困难。另外，球磨机的工作环境应在15%以下，否则因摩擦和撞击产热，引起蜂胶熔化，难以实施粉碎作业。