蜂蜜中含有人体代谢所需要的多种营养物质，同时具有补中、润燥、止痛及抑制和杀灭细菌的作用，所以蜂蜜既是食品，又广泛地应用于医学上。蜂蜜为中药材饮片炮制中常用的辅料之一，其炮制用蜂蜜的目的是，使蜂蜜渗入药材饮片组织内部，以改变药性，增加疗效或减少副作用。

胃肠道疾病蜂蜜具有滋润滑肠的作用，常作为缓泻剂，常用来治疗习惯性便秘、老年人和孕妇便秘，以及结肠炎、胃和十二指肠溃疡、儿童痢疾等疾病。如麻仁丸、仲景胃灵丸等。

肝脏疾病蜂蜜含有大量单糖、维生素、氨基酸和酶类，可以不经过肝脏而直接被人体吸收利用，因此食用蜂蜜既能促进人体新陈代谢，增加肝糖的储存功能，滋润保护肝脏，促进肝细胞再生，又可预防脂肪肝形成，提高人体抗感染能力。如龙胆泻肝丸、舒肝丸、柴胡舒肝丸等。呼吸系统疾病蜂蜜有消炎润肺、祛痰止咳、缓解疼痛等功能，同时还能使人体血红蛋白增加，降低血沉。如蜜炼川贝枇杷膏等。

 心脏疾病蜂蜜中含有容易被人体吸收的葡萄糖，能增强心肌和改善心肌的代谢功能。蜂蜜能使血管舒张，扩张冠状动脉，改善冠状血管的血液循环，使血液的成分正常化，血红蛋白含量增加，心血管张力加强。如再造丸等。 神经系统疾病蜂蜜所含的葡萄糖、维生素以及磷、钙等物质能够滋润神经系统，调节神经系统功能紊乱，从而起到增加食欲、促进睡眠的作用。如七味广枣丸、二十五味珊瑚丸。

 感染性创伤及烧伤蜂蜜中含有酸性物质和高浓度糖类物质，涂于创伤部位则细菌难以生存，同时所含的生物素等对机体代谢起着促进作用，使创伤部位能够迅速长出肉芽组织，故具消炎、解毒和抑菌等功效，能治疗感染性创伤，如下肢溃疡、小儿鹅口疮、冻疮、烫伤、褥疮，或皮肤外伤、各种烧伤。