蜂蜜中含有许多生物活性物质，其中嗜糖酵母菌对蜂蜜的储存十分不利，当蜂蜜含水量超过20%时，在适宜的温度条件下，可使蜂蜜发酵变质，失去营养价值。因此需要对蜂蜜进行消毒灭菌。目前多数采用的是巴氏灭菌法，主要有三种方式，即管式巴氏灭菌器、板式巴氏灭菌器和水浴灭菌。　　我国目前大多数加工厂，特别是小型加工厂最适宜的是水浴灭菌法。水浴消毒灭菌方法所采用的设备和水浴加热解晶基本相同。主要掌握加热时间和温度，一般在50-65°C条件下，加热半小时，可以达到消毒、灭菌的目的。