蜜蜂消化系统由一系列摄食、消化、吸收、排遗等器官组成。 与成虫比较，幼虫的消化和排泄系统相对简单。幼虫的前肠为一条短的导入管，称为口道，口道前端与口相连，后端连接中肠；中肠为一条容量非常大的盲囊，几乎与虫体同长；后肠为一条环状的肛道，连接中肠和肛门。

成虫消化系统虽然按起源和功能也是分为前肠、中肠和后肠， 但较为复杂。

蜜蜂成虫的前肠位于消化道前部，由咽、食管、蜜囊、前胃组成。前肠在胚胎时期由外胚层内陷形成，主要承担消化系统的摄食功能。中肠位于腹腔的前中部。中肠在胚胎时期由内胚层形成， 是蜜蜂消化食物和吸收营养的主要器官。中肠后端收缩，其开口连接后肠。后肠位于消化道的后段，由小肠和直肠组成。胚胎时期后肠由外胚层内陷形成，其主要功能为吸收水分、贮存和排出消化后的废物。