正常情况下，蜂王浆是通过蜜蜂生理代谢这一“生物屏障”的产物，外源物极少或没有。据颜志立等（2003年）报道，测定的金属含量远低于国家食品安全标准，而抗生素残留量合格率占80%(日本食品四环素族抗生素限量0.050毫克/千克)。

生产工具、人员的卫生和习惯（如操作时将挖浆工具、移虫针插入口内、水内、蜜中、淀粉里，盛浆容器的消毒、清洗等）影响蜂王桨的卫生。