蜂胶有抗鞭毛纲原虫、孢子纲原虫和纤毛纲原虫的作用。

Starzyk和Scheller等（1977年）用蜂胶乙醇提取物150毫克/升浓度对阴道毛滴虫作用24小时就出现杀灭效应，说明毛滴虫对蜂胶很敏感。

Hollands等（1988年）用3%的蜂胶乙醇提取物治疗受艾美耳球虫的中型艾美耳球虫和穿孔艾美耳球虫感染的实验动物发现，蜂胶的抗原生动物的效力比其他的药物高。

Torres等（1990年）用动物体外实验评估了蜂胶乙醇浸提液对寄生性原生动物兰伯氏贾弟虫生长的作用。当蜂胶乙醇浸提液的浓度为11.6克/升时，对98%的兰伯贾弟虫具有抑制作用。

Higashi等（1994年）报道，蜂胶乙醇提取液和蜂胶二甲基亚砜提取液对3种原生动物都有抗性。但前者的作用比后者强。当蜂胶乙醇提取液的浓度为100毫克/升时，24小时后血液中所有的锥虫都被解体。